Title:
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ESCALONAMENTO DE TAREFAS EM FERRAMENTA DE SEQUENCIAMENTO GENÉTICO |
Author(s):
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Jéfer Benedett Dörr, Guilherme Galante, Luis Carlos E. de Bona |
ISBN:
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978-972-8939-96-0 |
Editors:
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Cristiano Costa e Pedro Isaías |
Year:
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2013 |
Edition:
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Single |
Keywords:
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Bioinformática; Escalonamento de Tarefas; Sequenciamento Genético. |
Type:
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Full Paper |
First Page:
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183 |
Last Page:
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190 |
Cover:
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Full Contents:
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Paper Abstract:
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Este trabalho propõe um escalonador de tarefas para controlar a demanda de envio de lacunas encontradas durante o processo de sequenciamento genético para o processamento, considerando os recursos computacionais disponíveis. Estas lacunas são espaços sem representação no processo de sequenciamento genético. Esta atividade gera muitas tarefas concorrentes que consomem uma grande quantidade de recursos computacionais, principalmente memória. O objetivo do escalonador é evitar que sejam solicitados mais recursos computacionais do que os que podem ser fornecidos, pois nesse caso, o sistema sofre degradação de desempenho e causa atraso no tempo de processamento das tarefas. A motivação para este trabalho é a melhoria na eficiência da execução do fechamento de lacunas no sequenciamento de genomas. Para a avaliação da proposta, foi implementado um escalonador de lacunas com políticas de escalonamento baseadas no monitoramento dos recursos computacionais. |
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